Некоторые программы (например, hex-редактор biew) вообще не имеют configure-файла. Это значит, что настраивать программу приходится вручную, путем редактирования makefile. Звучит намного сложнее чем выглядит. Структура makefile довольно проста и фактически представляет собой последовательность команд и переменных. Вот переменными-то мы и будем управлять! Перечень возможных значений обычно содержится тут же, в комментариях.